הספר החאג' והמהנדס בצל הצפצפה, מגולל מערכת יחסים לבבית מרתקת בין ליאו - יהודה גרין 'המהנדס' הישראלי בשנות השישים לחייו, ובין חאג' ואליד אבו - סעיד, פלסטיני קשיש, עגלון ונהג בעבר, החיי בבית בנו במזרח ירושלים.
הישראלי והפלסטיני גרים בירושלים מאוחדת ומופרדת, הנושאת שני שמות: ירושלים ואל קודס.
במהלך השיחות בינהם, הנערכות על ספסל בצלו של עץ הצפצפה, נחשפים קורות המשפחות שלהם.
יחסי הידידות שבין החאג' הערבי לטכנאי הרדיו היהודי עוברים משברים עקב הפיגועים, הרס הבתין, המחסומים שבדרכים והעוצר המוטל על הערים הפלסטינאיות.
אבו - סעיד הוא עגלון ונהג חכם, משעשע, אוהב חיים, עממי ושובה לב. יהודה גרין הוא אדם מאופק, ניצול שואה, החש רגש אשמה מפני שהוא ניצל ואמו נספתה.
כל אחד מהם מסוגל לראות ולחוש את את האב של הזולת.
מחצית מן העלילה מתרחשת בירושלים ובכפרים הערביים שנחרבו במלחמת השחרור של היהודים, הקרויה בפי הערבים 'א - נכבה' - האסון.
המחצית השניה מתרחשת בשתי ערים בגרמניה: ויטנברג, עירו של מרטין לותר בה נולד ליאו גרין, וליבק, עירו של תומס מאן בה עובד וחי בנו הצעיר של חאג' ואליד, רפיק.
החאג והמהנדס בצל הצפצפה הוא רומן הרפתקאות סוחף, ובו הקורא חווה עלייה לרגל למכה, פיגוע בשוק ירושלים, לבטים של צעירים ישראלים וערבים המחפשים את זהותם ומסרבים להשלים עם הכיבוש וההרס, היחסים המורכבים בין יהודה לבין אשתו הצברית תמי.
כמו - כן, חושף הסיפור את עברן של שתי נשים גרמניות ופתר את החידה למה יושב החאג' בפתח החניון.
הרומן מאוכלס בדמויות של נשים יהודיות, ערביות וגרמניות בעלות יצרים עזים ודמויות גברים המתמודדים עם זהותם, כבני הארץ או כמהגרים.