לינדה, צעירה ניו-יורקית שזהותה מורכבת וחצויה, בתם של אם פלסטינית ואב יהודי, היא כתבת ברשת טלוויזיה אמריקאית המוצבת במזרח התיכון. בשל רגישותה האישית לסכסוך היא מחליטה להימנע מכתבות בישראל ובשטחים ולהתרכז בזירה העיראקית, אלא שאז פונה אליה מפקד לא-שיגרתי בחללי אל-אקצא, ומציע לה לצלם כתבה על נשים היוצאות לפעולת התאבדות בישראל. היא מוזמנת להכיר ולראיין אותן בימי חייהן האחרונים, בדרכן להתאבדותן הקטלנית. מרגע שלינדה מקבלת את ההזמנה, פצצות האדם מתחילות לתקתק...
מן העבר השני נכנסים לתמונה שירותי הביטחון הישראליים, בפיקודו של צעיר ישראלי מלא הפתעות, המנסה לגייס את לינדה או להשתמש בה כפיתיון. לינדה נסחפת לתוך סיפור של חיים ומוות שקורע אותה במאבקים פנימיים חסרי פיתרון - בין קצות זהותה החצויה, בין תמיכתה במאבק הפלסטיני לסלידתה העמוקה מנשק ההתאבדות, ובעיקר בין הזדהותה העמוקה עם גיבורות הסיפור לאתיקה העיתונאית הדורשת ריחוק. הבלתי צפוי והבלתי נמנע מתרחשים לבסוף - ולינדה הופכת לסיפור עצמו.
'עין הבובה' הוא רומן מתח פסיכולוגי-פוליטי מסעיר ומרתק, החודר לעומקה ולמורכבותה של נקודת המבט הפלסטינית, בלי שום ויתורים לקונצנזוס הישראלי.