`האפיפיור היהודי` הוא סיפור אגדה היסטורי על אלחנן, בנו של ר` שמעון ממגנצה, שנחטף מביתו, התחנך כנוצרי ומאחר שהתבלט בחכמתו עלה במעלות הכמורה ונעשה לאפיפיור. הגרסאות הרבות לאגדה זו מספרות על הדרך בה ביקש להיפגש עם אביו ולחזור אל חיק היהדות ומקצתן מספרות במותו על קידוש השם. `האפיפיור היהודי` היא לגנדה השייכת לאוצר היסוד של הספרות היהודית מימי הביניים ועדיין היא חיה ומספרת את גרסאותיה החדשות בימינו.
חיבור זה עוקב אחר גרסאותיו של הסיפור בעברית וביידיש קמאית, בכתבי יד מן המאה החמש-עשרה, בדפוסים ראשונים מן המאה השש-עשרה ובעיבודים ספרותיים חדשים מן המחצית השנייה של המאה התשע-עשרה, שהידוע בהם הוא הנובלה ההיסטורית של מרקוס להמן.
מעשה האפיפיור היהודי מביא לידי ביטוי דרמתי את העימות בין האליטות הלמדניות היהודיות בימי הביניים לבין העולם הנוצרי סביבן, ובוחן באמצעות גילומים ספרותיים ערכי יסוד של יהדות אשכנז, כגון תשובה וקידוש השם.