הספר סיפור האגדה - אחדות של תוכן וצורה כולל בתוכו ארבעה - עשר מחקרים על דרכי הניתוח והפירוש של סיפורי האגדה הקלסית (תקופת התנאים ותקופת ספרות האמוראים המוקדמת) לפי השיטה הפילולוגית - ספרותית. נושאי המחקרים מתחלקים לשלושה נושאי - משנה: (א) צורות סיפור, כגון תבניות, לשון נופל על לשון, עיצוב הזמן בסיפור, (ב) תכנים ורעיונות, כגון מעשה מרכבה ומלאכים, דמות תלמיד החכם התלמודי ו(ג) קביעת הגבולות בין סיפור האגדה לסיפור ההלכתי מצד אחד והסיפור העממי מצד שני. עשרה מן המחקרים שבספר כבר התפרסמו בעבר ועודכנו והותאמו לספר זה וארבעה מחקרים הם חדשים. כל פרקי הספר מעידים שאין להבין את סיפור האגדה אלא כאבר חי של התלמוד כולו ושאין להבין את סיפור האגדה בלי הרקע ההלכתי של בית המדרש התלמודי אשר בו הוא מצח והתפתח. המחבר, יונה פרנקל, פרופ' (אמריטוס) מן החוג לספרות עברית באוניברסיטה העברית בירושלים, פרסם מאמרים וספרים על פרשנות התלמוד, הוראת התלמוד, מדרש ואגדה והפיוט האשכנזי בימי הביניים, וביניהם עיונים בעולמו הרוחני של סיפור האגדה (תל - אביב תשמ"א), שהיה הספר הראשון בספריית "הילל בן - חיים" שבהוצאת הקיבוץ המאוחד.פרופ' פרנקל הוא חתן פרס ביאליק לחכמת ישראל לשנת תשנ"ד וחתן פרס ישראל לחקר התלמוד לשנת תש"ס.