יונים בשמי ירושלים הוא ספר ראשון מסוגו המנתח את המשא ומתן המדיני על מעמדה של מזרח ירושלים, ובוחן את היחסים בין יהודים לערבים בעיר מאז 1967.המחבר מראה כי בניגוד להנחה המקובלת, העיסוק בשאלת ירושלים כבר החל, ואף הושגה בו התקדמות ניכרת. במשא ומתן המדיני, כמו גם בחיי היום יום, אין הכרעה של אחד מן הצדדים, ומסתמנים יסודות של פשרה. הספר יונים בשמי ירושלים הוא התבוננות אמיצה במציאות הקיימת בירושלים ומסתמך על מגוון מקורות פלסטיניים, ישראליים וזרים. הוא מציג בפני הקורא את הנתונים המהימנים והעדכניים ביותר. בשל מקומה המרכזי של ירושלים בסדר היום הלאומי של ישראל, יש לספר חשיבות מיוחדת. ד"ר מנחם קליין הוא עמית מחקר במכון ירושלים לחקר ישראל ומרצה בכיר למדע המדינה באוניברסיטת בר - אילן. מחקרי מכון ירושלים לחקר ישראל מס' 81.