בתפילת 'נשמת כל חי' טמונים סודות עמוקים, המוסברים בהרחבה בתורת החסידות. בספר 'מעמקי נשמת' מוגשת תפילת 'נשמת' עם ביאורים בכמה רמות. תחילה ביאור פשוט של המילים. תחתיו מוגשים ביאורי החסידות בלשון בהירה, והם שופכים אור חדש על מילות התפילה. בחלקו השני של הספר מובאים ביאורי החסידות בלשונם המקורי, לטובת המבקשים ללמוד את הדברים בשפת המקור. לצד כל אלה מתוארים בספר פלאי הבריאה המוזכרים בתפילה, וכמו-כן משולבים בו אמרות וסיפורים קצרים הקשורים לתפילה ייחודית זו. 288 עמודי כרומו צבעוניים, המלווים בתמונות ואיורים.